教育

• 印第安纳大学物理学博士，布鲁明顿（2005-2012）
• 伊朗德黑兰沙里夫理工大学物理学硕士(2005)
• 伊朗设拉子设拉子大学物理学学士（2002年）

配置文件

我是圣犹大儿童研究医院的科学家。我目前的研究旨在利用基于潜在生物过程的计算模型，以及利用物理定律的表征，提供对癌症的机械见解。随着个体化癌症治疗的到来，个体肿瘤的特征及其对治疗反应的改变变得至关重要。我采用多尺度方法来解决这一挑战，通过整合从细胞和组织到全身的数据，以及模拟个体肿瘤的时空异质性，并探索它们如何改变肿瘤对治疗的反应。

研究兴趣

• 组织的多尺度计算模型
• 个体化的肿瘤生长模型和治疗反应
• 癌症异质性
• 基于图像的计算生物学

专业的活动:

荣誉和奖励

出版物

书章

• Swat M.，Thomas G.L.，Belmonte J.M.，Shirinifard A.，Hmeljak M.，Glazier J.A.（2012）。“使用CompuCell3D对组织进行多尺度建模”，《细胞生物学方法》，第110卷。

同行评议的出版物

1. Swat m.h.， Thomas g.l.， Shirinifard A.， Clendenon s.g.， Glazier J.A.(2015)。“实体肿瘤的紧急分层选择肿瘤细胞内聚减少:使用CompuCell3D的肿瘤进化的多细胞虚拟组织模型。”《公共科学图书馆•综合》。10 (6):e0127972。
2. Stewart E.，Shelat A.，Bradley C.，Chen X.，Federico S.，Thiagarajan S.，ShirinifardA.，Bahrami A.，Pappo A.，Qu C.，Finkelstein D.，Sablauer A.，Dyer M.A.（2015年）。“人类原位神经母细胞瘤异种移植物的发展和特征”，Dev Biol。pii:S0012-1606（15）00060-3。
3. Stewart E、Goshorn R、Bradley C、Griffiths L.M.，Benavente C.，Twarog N.R.，Miller G.M.，Caufield W，Freeman B.B.3rd，Bahrami A.，Pappo A.，Wu J.，Loh A.，KarlströMÅ，Calabrese C.，Gordon B.，Tsurkan L.，Hatfield M.J.，Potter P.M.，Snyder S.E.，Thiagarajan S.，Shirinifard A.，Sablauer A.，Shelat A.A.，Dyer M.A.（2014年）。“尤因肉瘤DNA修复途径的靶向研究”，《细胞报告》9（3）：829-41。
4. Sluka J.P.，Shirinifard A.，Swat M.，Cosmanescu A.，Heiland R.和Glazier J.A.（2014），“细胞行为本体论：描述被视为活性剂的真实细胞和模型细胞的内在生物学行为。”生物信息学，doi:10.1093。
5. Shirinifard A.，McCollum C.W.，Bolin M.B.，Gustafsson J.Å，Glazier J.A.，Clendenon S.G.（2013），“血管生成芽生长动力学的三维定量分析。”发育动力学。242（5）：518-26。
6. Steinkamp M.， Kanigel-Winner K.， Davies S.， Muller C.， Zhang Y.， Hoffman R. M.， Shirinifard A.， Moses M.， Jiang Y.， Wilson B. S.(2013)，“卵巢肿瘤附着、侵袭和血管化反映腹膜中独特的微环境:异种移植和数学模型的观点。”分子和细胞肿瘤学前沿3:97。doi: 10.3389。
7. Shirinifard A.，Glazier J.A.，Swat M.，Gens J.S.，Family F.，Jiang Y.，Grossniklaus H.E.（2012），“Bruch膜视网膜色素上皮光感受器外段复合体中的粘附失败决定脉络膜新生血管的模式：一项计算机模拟研究。”Ploscoputbiol 8（5）：e1002440。内政部：10.1371/journal.pcbi.1002440。
8. Heiland R.，Swat M.，Sluka J.，Zaitlen B.，Shirinifard A.，Thomas G.L.，Lumsdaine A.，和Glazier J.A.“为Computel3D可视化细胞及其连接图”，第二届IEEE生物数据可视化研讨会。
9. 张永强，张志强，张志强(2011)。"计算机模拟细胞分选由于不同的粘附力"PLoS ONE 6(10): e24999。
10. Popławski N.J.，Shirinifard A.，Ubirajara A.，Gens J.S.，Swat M.，Glazier J.A.（2010）。“模拟3D无血管肿瘤的前部不稳定性和侵袭性”，《公共科学图书馆综合》5（5）：e10641。
11. Shirinifard A.，Gens J.S.，Zaitlen B.L.，Popławski N.J.，Swat M.，Glazier J.A.（2009年）。“肿瘤生长和血管生成的三维多细胞模拟”，PLoS One。4（10）：e7190。
12. Merks R.M.，Perryn E.D.，Shirinifard A.，Glazier J.A.（2008）。接触抑制新生血管和新生血管生长的趋化性。4（9）：e1000163。
13. Popławski n.j.， Shirinifard A.， Swat M.， Glazier j .(2008)。“使用Glazier-Graner-Hogeweg模型和CompuCell3D建模环境模拟单物种细菌-生物膜生长。”数学Biosci Eng。4月;5(2): 355 - 88。
14. Shojai F.， Shirinifard A.(2005)。"波希米量子宇宙学中的经典极限和量子极限"国际现代物理杂志，第14卷，1333-1345页(2005)。